Особенность и ответственность инженерно-авиационной службы определялась и тем, что одновременно приходилось обслуживать более десятка типов самолетов; при этом кроме самолетов истребительного авиаполка практически все остальные являлись уникальными, не соответствовавшими по своему оснащению штатным, находящимся на вооружении однотипным самолетам. Они в основном были опытными самолетами, переоборудованными из штатных в самолеты-носители, самолеты-лаборатории, самолеты по отбору радиоактивных продуктов из облака ядерного взрыва и выполнению других функций, диктуемых обеспечением ядерных испытаний и внедрением для ВВС нового вида оружия.
Проводимые на полигоне экспериментальные работы требовали непрерывных доработок и изменений в конструкции самолетов. При этом должно было выполняться и строго соблюдаться требование в части согласования всего многообразия доработок с разработчиками авиационной техники. В этом отношении была налажена четкая оперативная связь с разработчиками, вплоть до пребывания на период испытаний на полигоне ответственных полномочных представителей от Министерства авиационной промышленности,
Инженерно-авиационную службу полигона возглавляли талантливые инженеры, прекрасные организаторы: Пономаренко А.П., Мамсуров Ю.Г., Дмитриев В.А., Рудой С.И. Особенно заслуживает быть отмеченным инженер-полковник Рождественский А.Н., обладавший незаурядными творческими способностями в реализации технических замыслов по дооборудованию самолетов.
Научно-испытательную часть (НИЧ) было поручено возглавлять заместителю начальника полигона инженер-полковнику Чернорезу Виктору Андреевичу, имевшему опыт руководства научно-испытательными работами в 4 Управлении ГК НИИ ВВС. В 1952 г. в связи с переводом генерал-майора Комарова Г.О. в другую часть он получил назначение на должность начальника полигона.