Два месяца спустя Вилигут официально был назначен главой отдела древней истории и доисторических времён в Rasse– und Siedlungshauptamt (Центральном управлении по вопросам расы и переселения), располагавшемся в Мюнхене. С этого времени сотрудничество Гиммлера с его советником по древним традициям становилось всё более тесным. В апреле 1934 года Вайстору было присвоено звание штандартенфюрера (полковника) SS. Хотя эта ветвь Allgemeine SS (общих SS) не требовала военной квалификации, являясь скорее «рыцарским орденом», чем боевым подразделением, факт того, что Вилигут носил звание полковника в австрийской армии, и храбро проявил себя на войне, укрепил его положение в организации Гиммлера.
Материалы Вилигута продолжали печататься в журнале фон Бюлова «Hagal» до 1935 года. Весной этого года Вилигут был перемещён из Мюнхена в Берлин, обосновавшись в собственном особняке по улице Каспара Тайса, 33, и стал членом личного штаба Гиммлера. Хотя работа Вайстора и была во многих отношениях близка к работе Ahnenerbe (отдела SS, занимавшегося исследованием германского наследия и культурной истории, основанного летом 1935 года), в сущности, его труды велись отдельно от этого института. Вилигут работал на Гиммлера лично, в то время как Ahnenerbe был частью большей структуры, отвечающей более объективным академическим канонам.
В числе значимых проектов, в работе над которыми участвовал Вилигут, значатся концепция о замке Вевельсбург как о «центре мира»; разработка перстня SS; создание различных ритуалов и разработка ритуальных предметов для церемоний SS; и кроме того, беспрерывный поток докладов эзотерического толка по теологии, истории и космологии, попадавшие, главным образом, лично к Гиммлеру.
Замок Вевельсбург — строение XVII века, расположенное подле Бюрена в Вестфалии. Впервые Гиммлер увидел замок в 1933 году, во время партийной командировки. Неясно, сопровождал ли его в той поездке Вилигут, но несомненно, что полковник оказал значительное влияние на Гиммлера в осмыслении роли замка как центрального штаба рыцарского ордена SS (Хюзер 1982: 33, 40).