Следующим провозгласил независимость Исмаил бин Ахмад, персидский правитель Согдианы. В 892 году он основал династию Саманидов, а в 903 году отвоевал Бактрию у Саффаридов. Саманиды способствовали возвращению традиционной иранской культуры, но оставались терпимыми к буддизму. Так, например, в период правления Насра II (годы правления 913 – 942) в саманидской столице Бухаре продолжали изготавливаться и продаваться резные изображения Будды. Их не запрещали как «будд-идолов».

В своих владениях Саманиды поработили тюркские племена и мобилизовали их на военную службу в армию. Если солдаты принимали ислам, им даровали условную свободу. Тем не менее, Саманидам сложно было поддерживать контроль над этими людьми. В 962 году Алп-тегин, один из тюркских военачальников, принявших ислам, захватил Газну (современный Газни), которая находится к югу от Кабула. В 976 году его преемник Себук-тегин (годы правления 976 – 997) основал там империю Газневидов в качестве вассала Аббасидов. Вскоре он отвоевал Кабульскую долину у индуистских шахов, оттеснив их назад в Гандхару.

Буддизм процветал в Кабульской долине, находившейся под управлением индуистских шахов. Асади Туси, в своей поэме «Гершасп-наме», написанной в 1048 году, описал роскошь главного монастыря Кабульской долины Субахара (Су Вихара), имевшую место во время захвата Газневидами Кабула. Из этого можно сделать вывод, что Газневиды не разрушили этот монастырь.

В 999 году следующий правитель династии Газневидов Махмуд Газневи (годы правления 998 – 1030) сверг Саманидов с помощью находящихся у них на военной службе тюркских рабов-солдатов.