Переведенная на многие европейские языки "Критическая история" Льоренте заставила замолчать на многие годы апологетов инквизиции. Другим не менее чувствительным ударом для них явилось трехтомное сочинение "История инквизиции в средние века" американского историка Генри Чарлза Ли, впервые опубликованное в 1888 г. Непревзойденная до сих пор по богатству использованных источников работа Ли признается даже некоторыми рьяными защитниками церкви как "самая широкая, самая глубокая и самая скрупулезная история инквизиции" из всех, написанных на эту тему.

Папский престол, хотя и вынужден был под напором общественного мнения прикрыть в своих владениях трибуналы инквизиции, продолжал до самых последних дней существования папского государства (1870) отстаивать свое право на преследование еретиков и применение к ним "принудительных мер", то есть продолжал отстаивать право на существование инквизиции. В апостолическом письме от 22 августа 1851 г. Пий девятый осуждал тех, кто пытается "лишить церковь внешней юрисдикции и власти принуждать, данной ей для обращения грешников на путь истинный". А в печально известном "Силлабусе" ("Полном перечислении главных заблуждений нашего времени", изданном в 1864 г. в виде приложения к энциклике "Quanta cura") предаются анафеме все те, кто утверждает, что "церковь не имеет права пользоваться силой" (Ecclesia vis inferendai potestatem non habet).

В конце девятнадцатого века, когда католическая церковь при папе Льве XIII перестроилась и вступила в союз с буржуазией для совместной борьбы с революционным рабочим движением, ее идеологи отважились вновь выступить в защиту "священного" трибунала. Многие из них, как мы уже показали, повторяют аргументацию своего наиболее блистательного, но столь же неудачливого предшественника Жозефа де Местра. Другие, в особенности из числа пресловутых борцов против коммунизма, восхваляют инквизицию за "действенность" ее методов в борьбе с еретиками.