Через некоторое время Нострадамусом заинтересовалась инквизиция. Его заподозрили в ереси и непочтительном отношении к христианским постулатам. Вероятно, эти обвинения имели под собой почву: родители Нотрдама, официально приняв христианство, втайне продолжали исповедовать иудаизм. В традициях этой же религии они воспитывали и сына. Да и изучение каббалы, которым занимался Нотрдам, было несовместимым с христианством.

А вскоре нагрянула и настоящая беда – на Прованс наступала чума. Эта страшная болезнь унесла жизни близких для Мишеля людей – жены и детей. Но, несмотря на горе, молодой доктор вступил в борьбу со страшной болезнью. Он переезжал из Марселя в Экс, из Тулузы в Лион, но чуме было трудно противостоять, ведь в те времена еще не умели лечить эту страшную болезнь. Люди просто спасались бегством. Вместе со всеми бежали и врачи. Только Нострадамус в одиночку противостоял губительной заразе.

Лечением чумы заниматься было бесполезно, и молодой врач направил все свои усилия на ее профилактику. Он заставлял горожан проветривать дома, мыть руки, окуривать помещения дымом пряностей. Советовал постоянно держать во рту пилюли из корицы и гвоздики. Причем он готовил их на свои собственные средства и раздавал на улице всем желающим бесплатно.

Он стал организатором карантина, изолируя зараженные кварталы. Молодой врач без страха сражался со страшной болезнью и днем и ночью, и случилось чудо – чума отступила. Столица Прованса чествовала Нотрдама как героя. Муниципалитет города назначил спасителю пожизненную пенсию, а горожане подносили ему щедрые дары. Но врач пожертвовал все сиротам и вдовам погибших от заразы людей.

Многие исследователи жизни Нострадамуса считают, что он черпал свои знания из древнего учения каббалы. Впрочем, многие известные ученые и мудрецы прибегали к этому старейшему источнику знаний. Даже Пифагор был поклонником древней мудрости, заключенной в каббале.