Военно-политическое руководство государства пытается в ходе реформирования армии и флота взять все лучшее, что было у царской и Советской армии. Однако отсутствие разработанной теории военной и военно-морской наук не позволяет увидеть характер будущей войны и вооруженной борьбы, роль видов Вооруженных сил. Это не позволяет создать Вооруженные силы нового типа, соответствующие совершенно новым угрозам России, которые несет XXI век. Принятая в апреле 2000 года военная доктрина наполнена общими понятиями и не раскрывает потенциальные опасности и угрозы, характер будущей войны, формы и способы ее ведения. Нет ясности в вопросах, как строить Вооруженные силы, к какой войне их готовить.
Общими для военной науки и ее составной части - военно-морской науки являются общественно-политическое содержание войны, законы войны и вооруженной борьбы, а также зависимость развития армии и флота от экономического потенциала государства. Однако специфика ведения вооруженной борьбы на море всегда выделяла военно-морскую науку в самостоятельное направление.
Следует подчеркнуть, что именно на базе военно-морской науки после Великой Отечественной войны была разработана теория строительства океанского флота в СССР. Тогда эта теория была реализована в четырех десятилетних кораблестроительных программах, благодаря чему в 80-е годы XX столетия было завершено строительство океанского ракетно-ядерного флота.
Однако в середине 70-х годов XX века руководство Генерального штаба ВС СССР волюнтаристски "отменило", а точнее, наложило запрет на военно-морскую науку исходя из того, что военная наука в целом якобы способна самостоятельно вести разработку теории вооруженной борьбы во всех сферах, в том числе и на море.