После начала военных действий группа ЗФ была развернута до 6 рефератов. В июне 1941 г. был сформирован основной координирующий орган группы ЗФ на Восточном фронте — штаб «Валли-3», являвшийся органом группы.

Группа ЗУ вела дезинформационную работу на противника через агентуру и имела в подчинении радиоконтрразведывательную службу и обрабатывала перехваченные радиограммы. Помимо этого группа выпускала ряд пособий для военнослужащих, в которых рассказывалось о методах работы разведорганов противника, вела дневник деятельности отдела Абвер-3. Группу последовательно возглавляли: полковник Армстер (до 1943 г.), полковник Шеффер и подполковник Кортельери. Рефераты возглавляли капитан Бертог, майор Фогель, правительственный советник Еминг.

Группа вела свою работу в тесном контакте с группой ЗФ и РСХА.

Группа ЗД вела радиоконтрразведку и с весны 1943 г. влилась в состав группы ЗУ.

Группа ЗГ (Гутахтен — экспертиза) проводила экспертизы при расследовании военным трибуналом фактов пропажи секретных документов и разглашения государственной тайны. Сотрудники группы определяли значение утерянного документа и возможный ущерб обороне государства в случае его хищения спецслужбами противника. Начальник — полковник Мюнх.

Группа ЗН (Нахрихтенвезен — связь) осуществляла контроль за почтовой, телефонной, телеграфной и радиосвязью. Группа добывала информацию из переписки заграничной корреспонденции и передавала ее в группу ЗФ и в РСХА. Группу возглавлял до 1943 г. подполковник Леман-Гейнике, после него — корветтен-капитан Клауз.

Группа Ц Арх (Центральный архив) проводила контрразведывательное прикрытие аппарата Верховного Командования вооруженных сил (ОКБ), верховного командования сухопутных сил (ОКХ) и Управления Вооружений верховного командования ВМС (ОКМ). До 1943 г. работой группы руководил полковник Шрадер, затем — полковник Олендорф и подполковник Гемпель.