Во всех крупных военных гарнизонах, укрепрайонах и отдельных промышленных центрах Абвер имел своих сотрудников — абверофицеров, одновременно являющихся представителями ACT и АНСТ. Эти сотрудники самостоятельно вели контрразведывательную работу среди местного населения, в тыловых учреждениях и на промышленных объектах.

Еше одним структурным подразделением Абвера были «Кригсорганизацьон» (КО), или «Военные организации». Их создание началось с 193? г. под различными «крышами» дипломатических представительств в ряде стран-союзниц Германии или стран-нейтралов. КО вели разведывательную работу против стран возможных и явных противников Германии. Такие организации были созданы в Финляндии, Швеции, Румынии, Венгрии, Болгарии, Турции, Иране, Афганистане, Китае, Испании, Швейцарии, Голландии, Португалии и Бельгии. Сотрудниками этих нелегальных разведорганов являлись немецкие офицеры Абвера, числившиеся на постах помощников военных атташе, вице-консулов, секретарей и вспомогательного персонала.

В странах, ориентирующихся на Германию, КО действовали с полного ведома и согласия спецслужб этих государств. Так было в Финляндии, Румынии, Болгарии и Испании. В ходе Второй мировой войны некоторым КО был придан статус ACT. Помимо ведения разведки, КО играли роль связных органов между Абвером и спецслужбой страны нахождения конкретной КО. Отсутствие таких органов, однако, не мешало установлению теснейших контактов и взаимодействию между Абвером и разведслужбами Эстонии и Латвии. Финляндия и Эстония пользовались услугами Абвера для переброски своей агентуры на советскую территорию.

В первоначальный период своего довоенного существования штат КО состоял из 1 офицера отдела «Абвер-1» и вспомогательного сотрудника. Перед началом войны с СССР и во время нее КО в Румынии, Болгарии и Финляндии были пополнены офицерами отделов «Абвер-2» и «Абвер-3» и всех наиболее важных отделов «Абвера-1». Это способствовало превращению КО в передовые центры германской разведки.