Управление состояло из пяти групп (отделов), из которых группы VЦ и VД имели постоянный контакт в работе с органами Гестапо и СД.
Группа VII. Группа вела розыск уголовных преступников. Одновременно со своими периферийными органами была техническим аппаратом по розыску объявленных Гестапо в розыск лиц.
Группа VД. В составе этого подразделения находились три научно-исследовательских института: уголовно-технический, уголовно-биологический и уголовно-медицинский. Институты производили для гестапо экспертизы и анализы вещественных доказательств. Эти НИИ также выполняли специальные поручения VI управления РСХА. В частности, уголовно-технический институт вместе с уголовно-медицинским изобрел яд, следы которого в организме после отравления было невозможно установить.
VI управление — зарубежная разведслужба СД
Начальник управления — бригаденфюрер СС Шелленберг Вальтер.
VI управление располагало кадрами опытных разведчиков и многочисленной агентурой, вело широкую разведывательную и подрывную деятельность во многих странах мира.
Структура VI управления по состоянию на 1 октября 1943 г.:
Группа VIA. Организация заграничной разведслужбы. Начальник группы — штурмбанфюрер СС Герберт Мюллер.
Группа VIB. Зона действия — Западная Европа. Начальник группы — оберштурмбанфюрер СС Штеймле.
Группа VIЦ. Группа вела подрывную работу главным образом против СССР. Начальниками группы последовательно были оберштурмбанфюреры доктор Грейфе и Рапп.
В группу входили 13 рефератов: первые три работали против СССР, а остальные против Ближнего, Среднего и Дальнего Востока.
В группу входил особый реферат VI Зет, руководивший созданным в марте 1942 г. разведывательно-диверсионным органом «Предприятие «Цеппелин»». Руководителем этого реферата был штурмбанфюрер СС Курек.