Докладу была дана положительная оценка со стороны Н.И. Рыжкова. 7 января 1989 г. состоялась встреча Абалкина с Генеральным секретарем ЦК КПСС. Таким образом, был прерван период охлаждения отношений к институту и его директору со стороны высшего руководства страны, который продолжался после памятного выступления Л.И. Абалкина на партийной конференции. Выводы, сделанные в докладе, были приняты. Институт стал интеллектуальным центром и главной научной базой экономических реформ.

Вскоре Л.И. Абалкин был избран народным депутатом СССР. Затем был назначен заместителем Председателя Совета Министров СССР Н.И. Рыжкова. Абалкин возглавляет комиссию по экономической реформе, это был достаточно серьезный с его стороны шаг. В середине 1989 года экономическая ситуация в стране находилась еще под контролем, а рычаги управления не были выпущены из рук, хотя уже начали давать сбои. Тем не менее нарастал экономический кризис: темпы роста общественного производства стремительно снижались, приближаясь к нулевой отметке; дефицит бюджета мог обернуться беспрецедентной суммой, доходящей до ста двадцати миллиардов рублей; тяжелым грузом на самом бюджете лежали различного рода дотации. Контроль над ростом денежных доходов ослабляли начинавшие распространяться быстрыми темпами демократические лозунги и требования безграничной свободы хозяйственной деятельности.

В политической сфере происходили еще более сложные явления, которые затем стали просто катастрофическими для страны и привели к распаду СССР. Начались первые, печально известные, массовые забастовки в угольной промышленности, разрушение традиционных структур административной системы управления, которое существенно опережало формирование рыночных механизмов, нарастали центробежные силы сепаратизма в республиках Советского Союза. А избранные Советы не могли быть дееспособны. Кризис политической системы отразился на экономике страны в полной мере. Она становилась неуправляемой.