На самом деле жертвами терактов стали 2993 человека: 19 террористов, 246 пассажиров и членов экипажей самолетов, 2603 в зданиях ВТЦ и на земле, в здании Пентагона 125 граждан США, в том числе 96 граждан и выходцев из стран бывшего СССР. 24 человека остаются в списках пропавших без вести.
Погибли 341 пожарный и 2 пара-медика Нью-Йоркского пожарного департамента, 60 полицейских и 8 сотрудников «Скорой помощи».
В Нью-Йорке было опознано более 1600 тел, но остальных (около 1100 человек) опознать не удалось. Сообщалось, что на месте трагедии найдено «около 10 000 фрагментов костей и тканей, что несопоставимо с количеством погибших». Фрагменты костей были найдены даже в 2006 г., когда подготавливали к сносу здание Deutsche Bank.
Было создано множество фондов, оказывавших финансовую помощь пострадавшим и семьям погибших. До срока окончания подачи заявок 11 сентября 2003 г. было получено 2833 заявки от семей погибших.
Кроме разрушения двух 110-этажных башен ВТЦ, были серьезно повреждены или уничтожены другие строения ВТЦ, отель Марриотт Велд Центер и православная греческая церковь Святого Николая. Здание Немецкого банка, находящееся на другой стороне Либерти-стрит, было признано непригодным для пребывания людей и снесено в сентябре 2007 г. Одно крыло Пентагона серьезно повреждено огнем и взрывом, часть здания обрушилась.
Через несколько часов после терактов началась масштабная организация по поиску и спасению выживших. В обломках было найдено только небольшое количество раненых, и через неделю стало понятно, что больше выживших найти не удастся. Спасение выживших и работы по разбору завалов заняли очень много времени, несколько недель потребовалось только на то, чтобы потушить пожары. Горение и тление в завалах продолжались 99 дней, прежде чем огонь был полностью потушен. Очистка территории завершилась только к марту 2002 г. Были сооружены временные деревянные платформы, с которых туристы могли наблюдать, как специальные команды занимаются разбором обломков на том месте, где стояли башни ВТЦ. 30 мая 2002 г. эти платформы убрали.