Пропасть между земноводными и пресмыкающимися: для размножения земноводные откладывают тысячи мягких студенистых яиц (икринок), где происходит наружное оплодотворение. Пресмыкающиеся же используют яйца со скорлупой. Но для этого требуется внутреннее оплодотворение до того, как яйцо оденется скорлупой. Существует еще одно радикальное различие: земноводные выходят из икринок в виде головастиков, а пресмыкающиеся вылупляются из яиц полностью развитыми, а для того, чтобы выбраться из скорлупы, зародыш снабжен специальным яйцевым зубом. Также имеются десятки сложных различий, которые эволюционная теория до сих пор не смогла объяснить. Главные из них - разное биологическое строение яйца и икринки, а также совершенно различные химические процессы, происходящие в них.
Пропасть между пресмыкающимися и птицами: тогда как первые являются холоднокровными животными, вторые - теплокровные. Сердце пресмыкающихся трехкамерное, а сердце птиц - четырехкамерное. Дыхательная система птиц уникальная и не имеющая аналогов. У пресмыкающихся и млекопитающих легкие вбирают и выпускают воздух, как кузнечные мехи, которые то наполняются, то опорожняются, а у птиц в процессе дыхания через легкие проходит постоянный поток свежего воздуха, причем в одном направлении. Кроме того, птицы обладают "двигателем" с воздушным охлаждением: система воздушных мешков простирается на все важные части тела (в том числе на полости костей), и при помощи внутренней циркуляции воздуха избыток тепла удаляется. Птицы имеют в своих глазах больше светочувствительных клеток, чем любые другие живые существа. Также они обладают роговыми клювами разной специализации. Красивое пение птиц осуществляется не голосовыми связками, а нижней гортанью.