Основной организованной силой в Совете Федерации было пропрезидентское лобби — группа «Федерация», которая была образована, по некоторому мнению, для фактического ослабления влияния крупных региональных лидеров.

В группу входило 103 человека. Интересно, что в ее структуре были образованы внутренние комиссии, которые фактически дублировали официальные комитеты и комиссии СФ. Такое внутреннее структурирование фактически сводило на «нет» влиятельность руководителей «настоящих» комитетов, так как основное обсуждение велось на заседаниях «Федерации».

Представителем группы по внешним связям был Михаил Маргелов, ныне — один из советчиков Путина по внешнеполитичским вопросам. Александр Торшин был назначен ответственным секретарем группы. Кроме ответственного секретаря в группе действовали пять координаторов, за которыми были закреплены определенные направления работы внутри группы, однако это распределение было достаточно номинальным — помимо них в группе были руководители комиссий, совет группы, решения которых имели преимущественное значение.

На созданных группой «Федерация» комиссиях велось обсуждение законопроектов и вырабатывать мнение группы относительно голосования по тем или иным вопросам.