При большом загрязнении яйца, предназначенные для инкубации, моют. Делают это очень осторожно. Для очистки применяют 1 %-ный раствор перекиси водорода или слабый раствор марганцовки, но предварительно опустив яйца в чистую воду с температурой на 5 °C выше, чем у яиц.

Для инкубации отбирают яйца, снесенные до 8 часов утра, правильной овальной формы и не имеющие дефектов скорлупы (это пояски, крупные бугорчатые отложения извести). Из яиц неправильной формы (круглая, слишком удлиненная, сдавленная) выводятся неполноценные птенцы, а трещины в скорлупе нарушают газо- и водообмен.

Свежее яйцо имеет матовую поверхность, так как скорлупа покрыта тончайшей надскорлупной пленкой, предохраняющей от проникновения микробов в яйцо.

Для насиживания яйца тщательно отбирают, просматривая на свет. Пригодные для насиживания яйца, имеют равномерно просвечивающуюся скорлупу и темно-окрашенный желток, который находится примерно в центре. При вращении яйца желток медленно отходит со своего места. Белок не должен иметь пятен.

Яйца собирают для дальнейшей закладки на инкубацию. Собранные на протяжении нескольких дней яйца хранят в прохладном (не выше 12 °C), сухом (относительная влажность не выше 75–80 %) помещении в горизонтальном положении и периодически переворачивают. При хранении выводимость снижается, поэтому, чем раньше будет заложено яйцо под наседку или в инкубатор, тем больше шансов получить птенцов. Срок хранения гусиных яиц для последующей инкубации не должен превышать 15 дней.

При необходимости продления сроков хранения и для повышения жизнеспособности эмбриона применяют следующий способ. Яйца на 5 часов помещают в инкубатор (температура воздуха 38 °C, относительная влажность 70 %). Затем теплые яйца убирают в прохладное помещение, где можно хранить до 15 суток. Эту процедуру следует выполнять не ранее второго дня и не позднее четвертого дня после сбора яиц.