Плодовые почки у крыжовника начинают закладываться в августе, обычно после того, как перестанут расти ягоды. Процесс дифференциации протекает до наступления холодов. В это время на разрезе почки можно видеть не только листья, но и бутоны.

Цветки крыжовника небольшие, собранные в кисти (по 2–3 цветка) или одиночные. Форма их колокольчатая, они пятерного типа (с пятью зелеными чашелистиками, пятью лепестками зеленоватой, белой или красноватой окраски, пятью тычинками). Завязь нижняя с большим количеством семяпочек. Пестик в верхней части двухраздельный.

Крыжовник — самоопыляющееся растение, но цветки выделяют нектар, благодаря чему их охотно посещают насекомые, способствуя перекрестному опылению. Если на плантации имеется пчельник и во время цветения стоит хорошая погода, то урожай ягод значительно повышается.

Листья у крыжовника 3–5-лопастные, голые или опушенные, без прилистников.

Куст крыжовника, выросший из семени, имеет стержневой корень. От него отходят боковые корни первого порядка. Они сначала растут наклонно, а затем круто опускаются вниз. На них вырастают корни второго порядка, затем третьего и так далее — до 6–7 порядков.

Корневая система кустов крыжовника, размноженного вегетативным путем (отводками, черенками), состоит из придаточных корней. Они вырастают из бугорков ткани — так называемых корневых почек, преимущественно сосредоточенных в узлах. На расстоянии 8–12 см от места прикрепления придаточного корня к побегу образуются боковые ответвления корней первого порядка, от них отходят корни второго порядка и т. д.

Основная масса питающих корней — так называемые корневые волосы — вырастают на корнях 5–7 порядков.

Корневая система взрослого растения состоит из корней различного возраста, находящихся почти полностью под кустом. В стороны корни распространены мало. На проницаемых почвах отдельные из них достигают глубины 1,5 м. Основная же масса их сосредоточена в слое почвы от 15 до 50 см.