Многие заводчики начали условно разделять курильских бобтейлов на внутрипородные типы по месту их происхождения, например кунаширский тип и итурупский тип (по названию островов Кунашир и Итуруп). Считается такое разделение ненужным и даже вредным для породы, поскольку, несмотря на некоторые различия в типе и способе формирования хвоста, животные достаточно однородны и дают прекрасные результаты при скрещиваниях между собой. Каждая из этих линий несет как положительные, так и отрицательные черты. Например, итурупские животные имеют более короткий и более сильно закрученный хвост, а кунаширские – более массивный костяк, тяжелую голову и густую, богатую шерсть. Более актуально объединить их преимущества, нежели получить 2 мало различимых неспециалистом типа бобтейлов, основанных на одной и той же мутации. Это задержит развитие породы и посеет лишнюю вражду и непонимание между заводчиками кошек.

К сожалению, при разведении «курильцев» использовалось достаточно много кошек с неизвестным происхождением, многие из которых имеют хвост, абсолютно нетипичный для аборигенных особей, или являются потомками запрещенных вязок с кошками других пород. Такие животные достаточно широко используются в разведении как из желания владельца заработать на популярной породе, так и из-за скудости исходного племенного материала. Правда, на сегодня появилось достаточно много энтузиастов, которые по единичной особе собирают племенной материал и ведут продуманную программу спариваний. Можно отметить несколько московских клубов: «Кошкин дом», «Талисман», «Алиса-Бест», которые серьезно относятся к разведению курильских бобтейлов.