На базе мандатной системы функционирует ещё одна собственная разработка Astra Linux — менеджер окон Fly. Этот рабочий стол наряду с простотой использования (термины большинства его объектов полностью соответствуют таковым в графическом интерфейсе знакомой абсолютному большинству пользователей Windows XP) обеспечивает разграничение на основе мандатной системы как программ с графическим интерфейсом к ответственному за графический режим X-серверу, так и самого X-сервера к аппаратным средствам графического режима (видеокартам, например). Согласитесь, возможность задать такие правила разграничения доступа — лишний способ закрыть целый ряд потенциальных лазеек.
Кроме собственной мандатной системы, Astra Linux обеспечивает и собственные механизмы очистки оперативной памяти и блоков файловой системы, которые содержали обрабатываемые ранее конфиденциальные данные. Это одно из требований сертификации к подобным системам. Оно реализовано в «Смоленске» в виде автономно функционирующего процесса, доступ к работе которого строго ограничен. А это значит, что ни одна из пользовательских программ не может остановить процесс такой очистки, чтобы скрытно собрать сведения об обрабатываемых ранее секретах.