Но судьба распорядилась иначе: в шестнадцать лет ее выдали замуж за богатого человека Жака Гийона, которого она увидела за два или три дня до свадьбы и который был старше ее на двадцать два года. После двенадцати лет несчастливого замужества она в двадцать девять лет осталась вдовой с тремя меленькими детьми.
Она была очень несчастлива, особенно в семье мужа, и ее единственным утешением была всепоглощающая вера в Бога и необоримое желание единения с Ним, но ей было очень трудно объединить мистические практики, почерпнутые из трудов Сале и Шантала, со своей молитвенной жизнью — она все дальше уходила в духовный тупик.
В этот критический момент жизни она познакомилась с молодым францисканцем, слова которого перевернули всю ее жизнь: "Ты падаешь в бездну все время, что я наблюдаю за тобой. Приучи себя ощущать Бога в собственном сердце и ты найдешь Его там". С этого времени, очищая себя, она начала практиковать крайний аскетизм, пребывая в постоянной молитве.
Через короткое время по протекции монахини Женевьевы Гранже она прошла через торжественное мистическое бракосочетание со Христом.
В это время мадам Гийон знакомится с основами мистического учения отца Лакомба, который оказал на нее большое влияние. Под влиянием его трудов она обрела духовный опыт, описанный в книге "Жизнь мадам Гийон". В ней она раскрыла суть "трех шагов" духовного возрождения.
Первый шаг — это "погружение" в созерцание Бога; второй — это "молитва простоты", которая помогает пребывать в состоянии молчания в Божьей присутствии; третий шаг проходит в активном созерцании, которое помогает душе, сознающей, что Бог владеет ею, разрешать Ему действовать и, оставаясь в покое, принуждает себя к Божественному, отрекаясь от всех своих собственных интересов. Этот последний шаг есть "чистая любовь".
Духовные искания Жанны Гийон изложены в трудах "Познание глубин Иисуса Христа”, "Союз с Богом", комментариях к "Песни Песней", "Духовные письма мадам Гийон", "Выход", "Книга Иова" и др.