Лаборатория, в Нью-Мексико, расположенная на территории Лос-Аламоса, получила название "Участок Y", а газообогатительный завод в Ок-Ридже (штат Теннеси) - "К-25".
За три года до того как бомба появилась на свет, она уже носила различные названия: "Агрегат", "Устройство", "Штучка", "Существо". "S-1". Позднее урановая бомба, спроектированная по принципу орудийного ствола, была названа "Большой худышкой". Поскольку плутониевая бомба должна была иметь центральное сферическое ядро, необходимо было предусмотреть значительно более крупную оболочку снаряда, поэтому бомба получила название "Толстяк". Когда в дальнейшем было принято решение укоротить пушкообразную трубу "Большой худышки", бомба стала называться "Малышом".
В служебных помещениях и на многих частных квартирах были тайно установлены звукозаписывающие аппараты, а к ведущим специалистам приставлены так называемые телохранители, которые не спускали с них глаз.
Манхэттенский инженерный округ был отнесен к высокой категории по снабжению всем необходимым. Щедро финансируемый, он рос как на дрожжах. Спешно подыскивались земельные участки для новых предприятий и лабораторий.
Манхэттенский проект состоял из нескольких подпроектов, которыми руководили ученые-физики. Р. Оппенгеймер был главой Лос-Аламосской научной лаборатории. Э. Лоуренс заведовал лабораторией радиации Калифорнийского университета, названной впоследствии его именем. Там совершенствовался электромагнитный метод разделения изотопов урана; лаборатория служила опытным заводом для громадного предприятия Y-12 в Ок-Ридже, где была получена основная масса урана, взорванного над Хиросимой.