20 ноября 1993 года на самолете Ил- 96 №96006 был выполнен первый рейс с пассажирами по маршруту Домодедово-Анкара-Домодедово. Как и у авиаторов ЦУМВС, это был не внутренний, а международный рейс (чартер). Лишь в 1994 году на региональной основе приступили к выполнению рейсов в Хабаровск, Петропавловск-Камчатский и Южно-Сахалинск.

Центральная панель кабины пилотов

Верхняя приборная панель

Штурвальная колонка и панель приборов командира корабля

Боковая штурманская панель

В процессе эксплуатации самолета Ил-96 домодедовцы во взаимном контакте с шереметьевцами (этот союз не распался по сей день) вносили множество замечаний в конструкцию самолета. По мнению летного состава, реакция на эти замечания со стороны КБ наступала без промедлений. Посильные изменения вносились. Посильные – потому что у КБ не было средств, а в скором времени и достаточного числа специалистов, чтобы своевременно устранять весь комплекс возникавших проблем, естественных при освоении новой авиатехники.

Устаревшая уже тогда отечественная электроника расслабляться не давала. Однажды произошел случай, чуть не окончившийся трагедией и поставивший под сомнение будущее самолета вообще.

В 1994 году в рейсовом полете на Тяньцзинь произошел отказ в инерциальной системе И-42, в результате чего образовался самопроизвольный завал самолета в крен, достигший максимального значения 52 градуса (что на 22 градуса больше предельно допустимого).