Всего до 1957 г. в Таганроге на заводе № 86 построили 123 самолёта 19 серий.

Летающая лодка Бе-6 – это цельнометаллический самолёт с высокорасположенным крылом типа "чайка", двух- килевым разнесенным хвостовым вертикальным оперением и подкрыльными неубирающимися в полёте поплавками.

Корпус лодки переборками делился на восемь отсеков, её днищевая часть снабжена двумя реданами. Редан – это поперечный уступ, предназначенный для того, чтобы оторвать струи воды и не дать им возможности "прилипать" к днищу и бортам лодки . По канонам аэродинамики наличие реданов крайне нежелательно, но законы гидродинамики несколько отличны, и чтобы оторвать самолёт от воды, приходится идти на ухудшение аэродинамических качеств. Передний редан имел прямую форму, задний – заострённую. Днище лодки до переднего редана плоскокилеватое, между реданами – плоское.

Двухлонжеронное крыло самолёта с углом стреловидности по передней кромке 10 град, состояло из центроплана, изготовленного заодно с лодкой, и консолей.

Подкрыльные плоскокилеватые поплавки поддерживающего типа делились переборками на четыре отсека, поскольку потеря им плавучести на взлёте или посадке завершалась поломкой или аварией самолёта. Передние стекла кабины экипажа и лопасти винтов имели спиртовую систему противообледенения и обмыва, а также механические стеклоочистители и электрические обогреватели.

В состав силовой установки самолёта входили два поршневых двигателя АШ-73 воздушного охлаждения мощностью по 2 400 л.с. каждый. Двигатели, снабженные турбокомпрессором, разрабатывались для самолётов Ту-4. Самолёт Бе-6, при всем желании, трудно причислить к высотным, поэтому турбокомпрессор исключили, а упрощение конструкции только способствовало повышению его надежности.