До февраля 1943 г. полк базировался в Монино, с февраля 1943 г. по июнь 1944 г. – в Чкаловской, затем – снова в Монино. В феврале 1945 г. полк перебазировался на аэродром Медвежьи Озера.

В 1945-1949 гг. 2-й транспортный авиационный полк выполнял:

– правительственные задания в интересах ЦК ВКП (б), Совета Министров СССР, министерства иностранных дел, министерства государственной безопасности, министерства кинематографии;

– оперативные задания Генерального штаба, Главного штаба ВВС, Управления технического снабжения по доставке пассажиров, технического имущества, различных грузов военным округам Московскому, Ленинградскому, Прибалтийскому, Прикарпатскому; Воздушным армиям – 4-й, 14-й и 16-й, а также советским войскам в Германии.

За четыре года экипажи 2-го ТАП выполнили 7239 самолето-вылетов, налетав 18177 часов, было перевезено 20596 человек и 1811 тонн грузов. Длина маршрутов составила 4 287 249 км.

С февраля 1947 г. полк базировался на Центральном аэродроме им. Фрунзе в Москве.

В 1948 г. одна эскадрилья полка освоила двухмоторные транспортно-пассажирские самолеты Ил-12. «Илы» оставались на вооружении полка всего четыре года: в 1952 г. 14 самолетов Ил-12 переданы из полка в другие части, взамен полк получил 16 самолетов С-47 и 9 самолетов Ли-2.

С 7 по 24 октября 1948 г. восемь экипажей полка по заданию Совета Министров СССР оказывали помощь населению Ашхабада, пострадавшему от катастрофического землетрясения. Было выполнено 70 самолето-вылетов с налетом 225 часов 38 мин., из них 10 полетов ночью; перевезено: 91 медработник, 350 человек населения города, 8 тонн медицинского имущества и 23 тонны различных грузов.