С их помощью совершались походы в глубь территории Ширвана, кыпчаки сыграли главную роль в победе Давида IV над Гянджинским атабеком Сельджукидов в Дидгорской битве 1121 года, в результате чего к Грузинскому царству уже в следующем 1122 году был присоединен Тифлисский эмират. Вскоре были присоединены Дманис (крепость Туманис в эпосе «Деде Горгуд») и Ани. Вместе с тем царь Давид, чтобы окончательно не испортить отношения с мусульманским миром, посетил Джума-мечеть в Тифлисе и запретил христианскому населению Тифлиса содержать свиней.

Монгольские завоевательные походы начала XIII века завершились включением всего Южного Кавказа, в том числе Борчалы, в состав государства Эльханидов – улуса Хулагу-хана и его потомков. Позже, в результате похода в 1386 году на Грузию, кыпчакские поселения севернее Тифлиса подчинил эмир Тамерлан. В XIV–XV веках Грузия находилась в составе или под влиянием государств Гарагоюнлу и Баяндурлу (Аггойонлу). Начиная с XVI века, в ходе османо-сефевидских войн переходивший из рук в руки Борчалы в основном находился в сфере влияния Сефевидов. Является неоспоримой реальностью то, что в правление шаха Аббаса I (1587–1629) в Борчалы и другие земли нынешней Грузинской Республики были переселены тюрки-азербайджанцы, но вместе с тем нельзя отрицать и обратный процесс: шах Аббас I, зная о расположенности гарапапагов к османцам, жителей множества селений Борчалы – Газахского махала переселил в области (беглярбекства) Гянджи – Гарабаха и Ширвана.

Наиболее сложным периодом в истории Борчалы можно считать XVIII век. Это связано с тем, что во время «избрания» в феврале 1736 года шахом Надир-хана, свергшего с шахского трона Сефевидов и узурпировавшего власть, против выступил очень влиятельный род Зиядоглу, представители которого традиционно являлись беглярбеками (наместниками) Гянджи и Карабаха. Через год после этого злопамятный Надир-шах в отместку отнял у них земли Борчалинского и Газахского султанств и переподчинил своему вассалу, грузинскому царю Теймуразу II.