В это же время, осмелевшая Австрия начинает вести себя вызывающе на Раштадском мирном австро-французском конгрессе, безуспешно заседающем ещё с 1797 года. В связи с началом военных действий, австрийская делегация покинула город. Французам ничего не оставалось делать, как поступить тем же образом. Однако на выезде из города на французскую делегацию напали австрийские жандармы и делегаты были убиты. Это событие было отрицательно воспринято во всём мире, в том числе и союзниками по антифранцузской коалиции. Суворов был крайне недоволен, и это стало началом его конфронтации с австрийским руководством.
Тем временем Моро отступает в Пьемонт и занимает сильную оборону, опираясь на крепости Аллесандрия и Верона. Суворов даёт отдых армии в Милане. Вновь побеждает Моро, и после непродолжительной осады, занимает город Аллесандрия, почти что сходу, проскочив малоприметную деревушку Маренго, не зная, что ей суждено стать звездой Наполеона. Сама деревенька была занята отрядом Багратиона.
Далее в течение 3-х месяцев, армия Суворова сводит на нет все предыдущие завоевания Бонапарта за 20 месяцев. (В 1800 году, что бы вернуть всё это он вновь потратит более полугода).
В это же время эскадра Ушакова высаживает десант на юге Италии. Отряд под командой капитана 2-го ранга А. Сорокина занимает город Бриндизи. Отряд контр-адмирала П. Пустошкина Анкону, а отряд капитана 2-го ранга Г.Г. Белли занимает Манфредонию и движется к Неаполю, столице Неаполитанского королевства (в то время, столица Партенопейской республики).
В июне ситуация достигла кульминации. Суворов в тяжелой четырёхдневной битве разбивает части генерала Макдональда, пришедшие на помощь Моро у Треббии, и вступает в Турин столицу Пьемонта.