В предыдущих параграфах рассматривались некоторые функции и движения в дыхательных циклах. Для выполнения этих движений требуется координирование дыхательных мышц. Эта координирующая деятельность производится мозговыми нейронами, собранными в дыхательном центре. Хотя костный мозг изолирован от остальной части мозга над уровнем, где он в него входит, тем не менее мозговой центр руководит мышцами при дыхании. Таким образом, ритм дыхания генерируется в нижнем стволе мозга. Отсюда мы можем ясно представлять себе, что дыхательные мышцы двигаются под воздействием нервной системы. Таким образом, нервная система поддерживает функционирование дыхательного цикла в процессе постоянного газообмена,. Дыхательный центр располагается в костном мозге и варолиевом мосту, частях центральной нервной системы (ЦНС). Регуляция ЦНС сердечно-сосудистой системы, расположенной в стволе мозга, в основном является автономной функцией и не поддается сознательному управлению.

Система регулирования дыхания, будучи также автономной функцией, воздействующей на нервные потоки, реагирует на разнообразную информацию, поставляемую ЦНС и окружающей средой, и таким образом рефлекторное движение видоизменяет обычное дыхание для удовлетворения наших жизненных потребностей. Это происходит само собой, когда мы спим или находимся в состоянии бодрствования, но не отдаем себе отчета в наших дыхательных циклах. Однако на какое-то время этот автономный процесс можно сознательно контролировать, используя движения дыхательных мышц для видоизменения дыхания (быстрое, медленное, изощренное), во время пения, игры на духовых инструментах, а также при искусном управляемом дыхании плюс задержка дыхания в курсах пранаямы. Однако не следует забывать, что нашему волевому контролю поставлен известный предел и в определенный момент система автоматической регуляции дыхания берет верх над нашим волевым усилиями.

Это является защитной функцией организма, своего рода ограничителем. Таким образом, следует учесть этот уровень перехода во избежание какого-либо дискомфорта или нанесения вреда организму.