Методологическим инструментом создания национальной идеи казахстанского народа «Саф Сана» явился метод системной философии. Эта методология позволяет создавать и реализовывать научные теории, а также крупномасштабные проекты и программы развития для реализации «Саф Сана». Истоками национальной идеи казахстанского народа «Саф Сана» являются мировоззренческие доминанты большинства казахстанцев. Они сформировались при системообразующем влиянии мировоззрения казахов и других тюркских этносов, многие поколения которых жили и живут на территории нынешнего Казахстана. Память о предках, уважение к старшим, бережное отношение к детям, уважение к женщине – эти и другие духовные и нравственные ценности, присущие тюркским этносам [16], в той или иной мере восприняты представителями всех этносов, проживающих на территории Казахстана. Способность культуры казахов и других тюркских народов к системному взаимодействию с культурами других народов дает прочную основу для формирования казахстанской нации в новых условиях суверенной страны.

Национальная идея казахстанского народа «Саф Сана», методология системной философии имеют единую системную направленность с Программой устойчивого развития ООН, со стратегическими приоритетами развития «Казахстан-2030» и Евразийской Парадигмой Президента РК Н. Назарбаева. Использование методологии системной философии может содействовать созданию системной концепции развития Казахстана и Евразийского Союза за счет обеспечения единства национальной идеи казахстанского народа со стратегическими приоритетами развития «Казахстан-2030» и Евразийской Парадигмой, предложенными Президентом РК Н. Назарбаевым, с принципами Программы устойчивого развития ООН.