Около 20 тыс. рек несут свои воды по горам, плоскогорьям и равнинам края. Каждый год реки сбрасывают в Карское море и море Лаптевых около 19,5 % общего стока вод России. Речная сеть края – самая крупная в стране и относится к бассейнам 6 крупных рек: Енисея, Оби, Лены, Хатанги, Пясины и Таймыры. Сток главной водной артерии региона, р. Енисей, составляет 548 км³, что в два с липшим раза больше стока Волги.

Ангара – один из трех крупных правых притоков Енисея. Ее энергия вращает агрегаты Иркутской, Братской, Усть-Илимской ГЭС.

Больших и малых озер – 185 тыс. Особенно их много на Таймыре, где в числе прочих находится одно из глубочайших озер России и мира – Хантайское (520 м). В горах Восточного и Западного Саяна разбросаны небольшие, но живописные озера – Ойское, Араданское, Манское. В Чулымо-Енисейской котловине есть озера тектонического происхождения, наиболее крупные – Белое, Учум, Инголь. Воды и грязи некоторых из них издавна используют для лечения различных заболеваний.

Край богат лесными ресурсами. Леса занимают 69 % его территории, и по запасам древесины он находится на первом месте в России (18 % общероссийских ресурсов). Более половины лесов приходится на лиственницу, около 17 % – на ель и пихту, около 12 % – на сосну и более 9 % – на кедр. Из мелколиственных распространены береза (около 10 %) и осина (1,5 %). Здесь находится треть всех кедровых лесов страны.

Зона тундры на полуострове Таймыр – это не только лишайники, мхи, травы и кустарники, характерные для всех подзон тундры, но и самая северная граница распространения леса.

Типичные обитатели приенисейской тайги – волк, бурый медведь, марал, косуля, лось, кабарга, соболь, колонок, росомаха, рысь, белка-летяга, заяц-беляк, бурундук, барсук, крот, глухарь, рябчик и др. В высокогорьях Саян встречаются такие редкие млекопитающие, как красный волк, снежный барс, горный козел, горный баран, серебристая высокогорная полевка, а из птиц – алтайский улар, клушица, хрустан, горный дупель, сибирский и горный вьюрок, альпийская завирушка, горный конек, краснозобый дрозд, белая и тундровая куропатка.