В 1781 году Екатерина Вторая реанимировала должность генерал-губернатора, добавив в систему городского управления новую деталь - выборную думу. Просуществовали екатерининские учреждения, как это у нас принято, до следующего монарха. Павел I заменил Городскую думу "Комиссией о снабжении резиденции припасами, распорядком квартир и прочих частей, до полиции относящихся". В то время фактическим хозяином города стал военный губернатор. На эту должность назначались люди заслуженные и, как правило, приближенные ко двору: П.А.Толстой, С.К.Вяэьмитинов, Д.И.Шульгин. Несколько месяцев в 1802 году в столице губернаторствовал М.И.Кутузов.

В 1817 году военным генерал-губернатором стал граф М.А.Милорадоаич - любимец Суворова, отличавшийся по воспоминаниям Дениса Давыдова "расточительностью, большой влюбчивостью и страстью изъясняться на незнакомом ему французском языке и танцевать мазурку"... Помимо этих явных достоинств Милорадович известен тем, что при нем начали строиться Михайловский дворец и новое здание Адмиралтейства.

Последним и, пожалуй, одной из самых ярких личностей на посту генерал-губернатора стал А.А.Суворов - внук великого полководца, занявший пост в 1861 году. Александр Аркадьевич был классическим примером человека на своем месте. Одни видели в нем гуманного правителя, другие обвиняли в излишнем снисходительстве, даже попустительстве. Суворов оказал содействие открытию "вольного университета", при нем окрепла воссозданная в 1801 году Городская дума, Петербург получил самый современный по тем временам транспорт - пассажирскую конку. Конец карьере Суворова на губернаторском поприще был положен покушением на Александра II Д.В.Каракозова. Именем Суворова была названа одна из линий Алраксина двора и улица на Охте (ныне ул.Помяловского).

В апреле 1866 года пост генерал-губернатора был упразднен. На короткое время власть над городом перешла в руки обер-полицмейстера.