...таких видал // Содом, а позже - Гива...- Содом - в Библии город, уничтоженный за грехи (Бытие, XIX). Жители города Гивы предавались такому разврату и содомии, подобных которым "не бывало и не видано было". Они потребовали выдать им на поругание странника, остановившегося на ночь в одном из домов. Им выдали наложницу, над которой они надругались до смерти (Суд., XIX 22-28).

Божества Ионии - греческие боги. Ионийцы - одна из основных групп древнегреческих племен. Населяли Аттику и побережье Малой Азии. Согласно древнееврейской традиции, родоначальником был Иаван, внук Ноя, четвертый сын Иафета.

Титан (греч. миф,)- Океан, старший сын Земли (Геи) и Неба (Урана). У него было три тысячи сыновей и столько же дочерей.

Сатурн - у римлян Крон - младший брат Океана.

На Крите и на Иде...- По преданию, Зевс воспитывался в пещере на горе Иде на острове Крит.

...В царствовали в воздухе срединном....- Теория средневековой физики разделяла воздух на три слоя (срединный - от лат. media regio). Боги Олимпа, в отличие от библейского, помещаемого Мильтоном в Эмпирее, правят в пределах земного неба: над ними облака, затем эфир, под ними тоже облака, скрывающие их от людей.

Дельфы - город у подножия горы Парнас, известный своим оракулом и храмом Аполлона.

В Додоне находился древний храм, посвященный Зевсу.

Дорида - здесь: вся Греция.

...словно те, что в оны дни...//Бежали в Гесперийские поля...- Согласно преданию, Сатурн, изгнанный Зевсом с Олимпа, один бежал в Италию. Гесперийские поля ("вечерние") - так называли древние греки Италию, а также Испанию, то есть страны, лежащие на запад от Греции. Здесь Мильтои имеет в виду путь завоеваний римлян, принесших своих богов в Кельтские земли (Францию, Испанию), вплоть до "дальних" островов - Британии.