Будучи командующим войсками Московского военного округа (с 4 февраля 1905 г. по 17 января 1906 г.), H. H. Малахов командовал воинскими частями, которые участвовали в подавлении мятежа и массовых беспорядков, происходивших в Москве в период с 7 по 18 декабря 1905 г. Много лет спустя Борис Алексеевич так вспоминал эти нелегкие дни: «Для меня этот год был трагизмом моих юных лет, глубоко ранивший мою юношескую душу и, по всей вероятности, предопределивший всю мою дальнейшую жизненную карьеру Москва стояла в самом центре революционной бури. На улицах шли настоящие бои. Батареи 1-й Гренадерской артиллерийской бригады громили "Пресню", т. е. центр рабочего восстания…

…В это тяжелое историческое время Государь Император соизволил назначить моего деда, Георгиевского кавалера Турецкой кампании — генерала от инфантерии Малахова на высокий пост — Командующего войсками Московского военного округа. Мой отец в это время уходит с батареей 1-й гренадерской бригады на Дальний Восток, и мы переезжаем на жительство к моему деду, то есть в здание Штаба Московского военного округа на Пречистенке.

Тяжесть сохранения государственного порядка в губернии и городе ложится полностью на плечи моего деда. Он постоянно выезжает на всякого рода совещания, а главное — в волнующиеся полки.

Два раза покушаются на деда. Первый раз его спасает присутствие духа его личного адъютанта, ротмистра Сумского гусарского полка князя Меньшикова-Корейши, а второй раз — самоотверженность конвойного казака урядника Золотухина. Страх царствует в доме — террор революции захватил и штабы. Образ бабушки, молящейся перед иконой святого Серафима Саровского за жизнь дедушки, на всю жизнь врезался в мое сердце»

Благородное происхождение предопределило выбор жизненного пути Бориса Смысловского. С детства ему прививался воинский дух, соответствующие ценности, необходимые будущему защитнику Отечества. Даже крещен он был в церкви Михайловской артиллерийской академии в Санкт-Петербурге, где его отец состоял в это время слушателем.