Хотя под действие циркуляра подпадало всего несколько тысяч еврейских семейств, правые фракции III Думы 26 ноября 1908 г. внесли заявление о запросе министру внутренних дел, в котором обвинили его в превышении власти, а также незаконности циркуляра, разосланного по всей России, и нарушении Свода законов. Запрос требовал точного соблюдения действующих законов о евреях и утверждал, что закон нельзя отменить министерским циркуляром (86) . По решению Думы заявление было передано в комиссию по запросам (87) , но осталось нерассмотренным (88) . Однако это не помешало властям отреагировать на запрос массовым выселением евреев в местности черты оседлости. Например, из Киева зимой 1910 г. выслали 1200 еврейских семейств (89) .
Третьеиюньский переворот стал переломным моментом во внутренней политике Столыпина, в том числе, в еврейском вопросе. "Правительство Столыпина объявило войну русскому еврейству", - писал Витте (90) . Конечно же, утверждение Витте, относившегося к Столыпину с нескрываемой антипатией, не является убедительным доказательством, хотя факты говорят сами за себя. Так, 14 сентября 1907 г. общее собрание членов Киевского губернского отдела "Союза русского народа" потребовали в письме Столыпину очистить Киевский политехникум от "засилия" евреев.
Резолюция премьера на полях письма была такой: "Наконец, среди грубой брани и требований, вызванных политиканством и интригой, дождался я от "Союза русского народа" мыслей правдивых и серьезных.