В 1918 году – член Президиума Сибирского военного комиссариата, а с июня – заместитель председателя и комиссар Сибирского верховного командования, начальник штаба Прибайкальского фронта. Осенью 1918 года участвовал в организации партийного подполья в Амурской области, с октября – член обкома РКП(б). В апреле 1919 года Михаил Трилиссер становится председателем Амурского обкома партии, с августа – членом областного военно-революционного полевого штаба. С мая 1920 года – председатель Амурского облревкома, секретарь Амурского обкома РКП (б), затем комиссар Дальневосточной республики по Амурской области. С октября 1920 года – член Дальневосточного бюро ЦК РКП (б) и Государственной политической охраны Дальневосточной Республики. В августе 1921 года назначен начальником закордонной части ИНО ВЧК, одновременно в апреле – ноябре 1921 года – заведующий Дальневосточным отделом Исполкома Коминтерна.

С декабря 1921 года Михаил Трилиссер – помощник начальника ИНО ВЧК – ГПУ, с мая 1922 года по октябрь 1929 года – начальник ИНО ГПУ – ОГПУ, с марта 1926 года одновременно – заместитель председателя ОГПУ. С 1928 года – уполномоченный ОГПУ при СНК РСФСР.

В 1927–1934 годах он – член ЦКК, а в 1930–1934 годах – член Президиума ЦКК ВКП(б), член ВЦИК.

В 1930–1934 годах Михаил Трилиссер – заместитель наркома Рабоче-крестьянской инспекции РСФСР. В 1934 году на 17-м съезде партии избирается членом комиссии советского контроля при СНК СССР и ее уполномоченным по Дальневосточному краю.

В 1935–1938 годах – член Президиума и кандидат в члены секретариата ИККИ под фамилией Москвин. Курировал деятельность спецслужб ИККИ, входил в комиссию секретариата ИККИ по переводу в ВКП(б) членов братских партий.

Арестован 23 ноября 1938 года.

1 февраля 1940 года осужден Военной коллегией Верховного суда СССР к высшей мере наказания и на следующий день расстрелян.

Реабилитирован в 1956 году

Станислав Адамович Мессинг с октября по декабрь 1929 года исполнял обязанности руководителя, а с декабря 1929 года по август 1931 года руководил советской внешней разведкой