Вторая ступень, на которой "открываются оставшиеся три чакры", проходит в течение одного семинара. Посвященные на этой ступени изучают уже не только технику лечения наложением рук, но и определенные знаки, мантры, которые "помогут им оказывать воздействие на расстоянии".
Следующая ступень - "Мастер". Мастера "Рейки" образуют свой профессиональный кастовый круг, проводят собственные семинары, на которых обсуждаются профессиональные и административные вопросы. Только мастера вправе проводить инициацию. Следует отметить, что среди рейкистов практически отсутствуют люди с медицинским образованием. Через год-два практик у рейкиста появляются различные видения, слышания, что руководителями объясняется как "открытие третьего глаза". На этом этапе рейкиста убеждают, что он становится обладателем совершенно новой кармы, судьбы.
Прошедшие посвящение регулярно собираются на различные культовые мероприятия. Тот мастер, от которого рейкист получил посвящение, становится его духовным наставником, в обязанность которого вменяется консультирование по любым вопросам, как профессиональным, так и личным, причем делается это через медитацию.
Семинары "Рейки" обязательно включают в себя беседы о трудах и заслугах Усуи, фотография которого находится на алтаре, перед которым совершают свои обряды рейкисты.