А вскоре корабли в тумане разошлись. По инструкции, если они разминутся в океане, следовало идти к острову Пасхи. Три дня простоял там шлюп Лисянекого, но встреча не состоялась. "Надежда" вышла к острову Нукагива (Маркизские острова), куда вскоре прибыла "Нева". (Момент встречи кораблей у острова Нукагива отобразил художник на третьей странице обложки).
В середине мая 1804 года корабли снялись с якорей ж пошли к Гавайским (Сандвичевым) островам. Стоянка здесь была недолгой. 10 июня после троекратного "ура" корабли разлучились. "Надежда" взяла курс на Камчатку, а "Нева" - к берегам Аляски.
Приход на Камчатку "Надежды" стал большим событием для жителей отдаленной окраины России. После разгрузки товаров и ремонта предстояло идти в Японию. Переход из Петропавловска в Нагасаки занял около месяца. Судно попало в тайфун. "Бесстрастие наших матросов, презиравших все опасности, действовало в сие время столько, что буря не могла унести ни одного паруса..., Ничто не могло противостоять жестокости шторма. Сколько я не слыхивал о тайфунах, случающихся у берегов китайских и японских, но подобного сему не мог себе представить... Каждое мгновение ожидали мы, что полетят мачты. Хорошая конструкция корабля и крепость вант спасли нас от сих бедствий",- писал И. Ф. Крузенштерн об этом тайфуне. Шесть месяцев находилась русская миссия в Японии, но никаких торговых отношений установить не удалось. Японское правительство упорно придерживалось закона, по которому никто из иностранцев не имел права подходить к берегам Японии.
На обратном пути в ПетропавловскКамчатский были положены на карту западное побережье островов Хондо (Ниппон), Хонсю и Хоккайдо, а также южная часть Сахалина. Кроме того, было обнаружено несколько еще не открытых Курильских островов. Затем Крузенштерн обследовал восточный и западный берега Сахалина. Ему не удалось пройти до конца Татарский пролив и он заключил, что Сахалин - полуостров. (Это географическое заблуждение просуществовало до 1849 года, когда Г. И. Невельской окончательно установил, что Сахалин является островом.)