Учебный план вечернего отделения был рассмотрен на Ученом совете ГУСС и утвержден начальником ГУСС в сентябре 1952 года. В его основу был положен учебный план физико-математических факультетов педагогических институтов, срок обучения на которых также составлял 4 года, с Дополнением ряда дисциплин, знание которых было необходимо в практической деятельности различных оперативных подразделений Управления.

Планом предусматривалось изучение 24 дисциплин. Из общего числа 2216 часов (лекций — 1350 часов, групповых занятий — 866 часов) на изучение специальных дисциплин отводилось 316 часов. Ведущее место в учебном плане отводилось изучению математических дисциплин — 47 % часов. В отличие от дневного отделения, где слушателям по окончании учебы присваивалась квалификация «инженер-криптограф» и диплом на руки не выдавался, а приобщался к личному делу, выпускники вечернего отделения получали диплом единого для всех вузов образца с присвоением им квалификации «инженер-вычислитель» по специальности «прикладная математика». Окончившим годичные курсы присваивалась квалификация «техник-криптограф», свидетельство на руки не выдавалось, а приобщалось к личному делу. В связи с этим выпускники нередко попадали в трудное положение при желании продолжить образование в гражданском вузе.

Решением о создании ГУСС при ЦК ВКП(б) предусматривалось и создание Научно-исследовательского института № 1 (НИИ-1). Положение о НИИ-1 было введено в действие постановлением Секретариата ЦК ВКП(б) от 9 июня 1950 года и приказом начальника ГУСС от 1 июля 1950 года. Этим положением в составе НИИ-1 предусматривались: ученый совет, аспирантура, специальная научно-техническая библиотека. В задачу НИИ-1 также входила организация научно-технического информирования и издание научных работ и учебных пособий.