1941 год ставший для нашей страны началом кровавой и жестокой войны, для Эрнесто оказался мирным. Мальчик поступил в Кордовский государственный колледж. Во время обучения, в котором его способности особенно проявились только литературе и спортивных дисциплинах. В те годы Латинская Америка жила гордым кипением воспоминаний Испанской революции, Эрнесто восхищается ее героями, знакомится и общается с испанскими красными эмигрантами, укрывшимися в Аргентине от преследований кровавого Франко. Родина Че в эти годы охвачена чередой грязных политических кризисов, венцом которых становится "левофашистская" диктатура Хуана Перона, к которому семья Гевары относилась крайне враждебно. Эрнесто на примере своей страны убеждается в лживости буржуазной демократии, лицемерии политиков, идущих на все ради установления своей власти. Хотя родители Эрнесто, были активными участниками антипероновских выступлений, сам он не принимал участия в студенческих революционных волнениях и вообще мало интересовался политикой во время учебы в университете Буэнос-Айреса. Эрнесто поступил туда в 1947 году, решив стать медиком, чтобы облегчать страдания другим людям. Вначале он интересовался в первую очередь заболеваниями дыхательных путей, что было ему ближе всего лично, но впоследствии увлекся изучением одного из самых страшных бичей человечества - проказы, по научному лепрой.

В конце 1948 года студент медик Гевара решает отправиться в первое свое большое путешествие по северным провинциям Аргентины на велосипеде. В течение этого путешествия он в первую очередь стремился завести знакомства и побольше узнать о жизни в беднейших слоях населения, и остатках индийских племен, обреченных на вымирание при тогдашнем политическом режиме. Именно с той поездки он начал понимать свое бессилие как медика при лечении болезней всего общества, в котором он жил. Картина увиденного поразила его.