Начиная с середины XIII в. и до середины XIV в., Сербия победила Болгарию, захватила часть византийских земель и стала крупнейшим государством на Балканах. У болгар и сербов процесс национальной консолидации был прерван в конце XIV в. османским нашествием. В 1361 г. османский султан Мурад I завоевал Фракию, а затем – остальные части Византии, в том числе весь Балканский полуостров. В 1371 г. турки-османы разбили южных сербов и болгар, в 1386 г. вторглись в Албанию и к 1393 г. завершили захват Сербии и Болгарии.

В середине XIV в. Европу охватила эпидемия чумы, выкосившая, по некоторым оценкам, до трети европейского населения. Преследуемые по обвинению в распространении чумы евреи совершили массовое переселение в области современной Польши, которую чума пощадила. Естественное перераспределение капитала на восток Европы, вследствие этого, значительно усилило торговый оборот и значимость славянских земель. Созданный незадолго до этого Ганзейский союз превратил Балтийское море в важнейший торговый путь, что облегчило включение большинства славянских стран в европейскую экономику.

В XIV – XVI вв. единая древнерусская народность дифференцировалась на три самостоятельных родственных народности – русских, украинцев и белорусов. В XVII-XVIII вв. эти три народности объединились вновь в составе одного государства, однако обратной ассимиляции восточнославянских народов не произошло.

В XV-XVI вв. на славянских территориях, находящихся под влиянием римско-католической церкви (Чехия, Польша, Словения) возникли реформационные протестантские движения, вызвавшие последующие религиозные войны.

В 1620 г. часть чешских земель включена в состав Австрийской империи. В XVII в. Лужицкие земли были уступлены Саксонии, в XIX в. вошли в состав Пруссии и затем – Германской империи.