1 управление (разведка за границей) — (П.М.Фитин);

2 управление (контрразведка) — (П.В.Федотов);

3 управление (секретно-политическое) — (С.Р.Мильштейн);

Следчасть (на правах управления) — (Л.Е.Влодзимирский);

УКМК — (Н.К.Спиридонов);

1 отдел (охрана правительства) — (Н.С.Власик);

2 отдел (учетно-статистический) — (Л.Ф.Баштаков);

3 отдел (обыски, аресты, наружное наблюдение) — (Д.Н.Шадрин);

4 отдел (опертехники) — (Е.П.Лапшин);

5 отдел (шифровальный) — (А.И.Копытцев);

Отдел кадров — (М.В.Грибов);

Административно-хозяйственный и финансовый отдел (АХФО) — (А.М.Давыдов);

Секретариат НКГБ СССР — (В.А Голованов).

Тогда же в феврале 1941 года Особый отдел ГУГБ НКВД СССР был расформирован, а вместо него были созданы: 3 управление Наркомата обороны (НКО) СССР и Наркомата военно-морского флота (НК ВМФ) и 3 отдел НКВД СССР (по оперативной работе в войсках НКВД), куда и были переданы функции бывшего Особого отдела бывшего ГУГБ НКВД СССР. Начальником 3 отдела НКВД СССР был назначен А.М.Белянов. Начальником 3 управления НКО СССР стал бывший начальник ОО ГУГБ НКВД СССР А.И.Михеев, начальником 3 управления НК ВМФ был назначен бывший начальник 10 отделения ОО ГУГБ НКВД СССР Петров А.И.

Приказом НКВД СССР № 00198 от 22 февраля 1941 г. для ведения шифрованной переписки НКВД СССР было организовано 6 отделение НКВД СССР. Начальником 6 отделения НКВД СССР был назначен А.А.Солодянников.

26 февраля 1941 г. была объявлена новая структура НКВД СССР:

Руководство НКВД СССР:

Л.П.Берия — нарком внутренних дел СССР;

СН.Круглов — 1 зам. НКВД СССР;

В.С.Абакумов — зам. НКВД СССР;

В.В.Чернышов — зам. НКВД СССР;

И.И.Масленников — зам. НКВД СССР по войскам;

Б.П.Обручников — зам. НКВД СССР по кадрам.