В 1940 году произошли следующие изменения в структуре НКВД СССР:

4 января 1940 г. на базе Отдела ж.д. строительства ГУЛАГа и Управления ж.д. строительства на Дальнем Востоке было образовано Главное управление лагерей ж.д. строительства (ГУЛЖДС) НКВД СССР. Его начальником был назначен НАФренкель.

Приказом НКВД СССР № 001013 от 17 августа 1940 г. в составе НКВД СССР было сформировано Главное управление политпропаганды войск НКВД СССР. Начальником этого главка был назначен дивизионный комиссар П.Н.Мироненко.

28 августа 1940 г. для руководства строительством авиационных заводов в Куйбышевской области было образовано Управление особого строительства (Особстрой) НКВД СССР во главе с заместителем начальника ГУЛАГа НКВД СССР А.П.Лепиловым.

13 сентября 1940 г. на базе Гидротехнического отдела ГУЛАГа было образовано Главное управление гидротехнического строительства (Главгидрострой) НКВД СССР во главе с Я.Д.Рапопортом.

29 октября 1940 г. в составе НКВД СССР было организовано Главное управление местной противовоздушной обороны (ГУМПВО) НКВД СССР во главе с В.В.Осокиным.

НКВД — НКГБ СССР

февраль 1941 г. — июль 1941 г

Указом ПВС СССР от 3 февраля 1941 г. НКВД СССР был разделен на два наркомата: НКВД СССР и НКГБ СССР наркомом внутренних дел СССР был назначен Л.П.Берия, а наркомом государственной безопасности СССР — В.Н.Меркулов.

3 февраля 1941 г. Л.П.Берия был также назначен заместителем председателя СНК СССР по совместительству, где ему поручили курировать работу НКВД, НКГБ, НКлеспрома, НКцветмета, НКнефтепрома, и НКречфлота.

Структура образованного НКГБ СССР быта следующей:

Руководство НКГБ СССР:

В.Н.Меркулов — нарком государственной безопасности СССР;

И.А.Серов — 1 зам. НКГБ СССР;

Б.З.Кобулов — зам. НКГБ СССР;

М.В.Грибов — зам. НКГБ СССР по кадрам.