Пятая глава посвящена органам НКВД-МВД, боровшимся с националистическим подпольем. Авторы сочли целесообразным не дробить этот материал по хронологическим отрезкам, а дать его за весь период 1939–1953 и.

В заключительной, шестой главе, показан процесс снятия ограничений по спецпоселению с граждан, выселенных из Западной Украины и Западной Белоруссии, Литвы, Латвии, Эстонии. Она включает документы за 1954–1956 гг.

В приложении № 1 к Сборнику публикуется доклад о деятельности Главного управления борьбы с бандитизмом за три года Великой Отечественной войны. В этом весьма обширном документе к теме данного Сборника относится только часть текста, однако авторы сочли целесообразным поместить его полностью, что позволяет сравнить положение в изучаемых регионах с другими республиками СССР, более объективно оценить степень остроты происходившей борьбы с националистическим подпольем».

Подготовка настоящего Сборника документов осуществлена в соответствии с «Правилами издания исторических документов в СССР» (2-е изд., 1990).

Большинство документов публикуется полностью. В тех случаях, когда документ содержит значительный объем, не относящийся к теме сборника, эта часть текста опускается и отмечается отточием, а содержание при необходимости оговаривается в текстуальных примечаниях.

Текст публикуемых документов передан в соответствии с современными правилами орфографии и пунктуации, стилистические особенности документов сохраняются. Неисправности текста, не имеющие смыслового значения (опечатки, орфографические ошибки), исправлены в тексте без оговорок. Пропущенные в тексте документов и восстановленные составителями слова и части слов заключены в угловые скобки. Повторяющиеся сокращения и сокращенные слова раскрываются в списке сокращений.