В 1698 году, находясь в Лондоне, Петр Первый приказал отыскать для будущей школы хорошего преподавателя математики и морских наук. Школа была открыта в январе 1701 года. Для работы в ней пригласили трех иноземных учителей. Это были англичане профессор Эбердинского университета Генри Фархварсон и моряки-навигаторы Стефан Гвин и Ричард Грейс из колледжа Крист-Черч. Фархварсон (на русский лад он стал зваться Андреем Даниловичем) обладал солидными по своему времени знаниями в области математики, астрономии, теоретической навигации, знал несколько языков, затем изучил русский язык. Он был назначен преподавателем математики, а его помощники Гвин и Грейс — преподавателями навигации.

Дом для школы подыскали такой, как просили учителя, «на высоком месте, чтоб можно горизонт видеть и примечать обсервацию и начертание и чертежи делать в светлых покоях….»

Начались занятия в- школе, и сразу же возникли немалые трудности: не было учебников, не хватало учебных пособий, занятия приходилось проводить посредством переводчиков, так как иноземцы не знали русского языка и к тому же выбор преподавателей, за исключением серьезного ученого Фархварсона, был не совсем удачен. Ни Гвин, ни Грейс особенного рвения к занятиям не проявляли.

По рекомендации куратора школы дьяка Оружейной палаты Алексея Александровича Курбатова (в прошлом крепостного боярина Шереметева) в феврале 1701 года зачислили в состав преподавателей школы Леонтия Филипповича Магницкого с дополнительной оплатой по «четыре деньги в день кормовых денег» за составление учебника арифметики.

Родился Магницкий в 1669 году. Он не принадлежал ни к знатным, ни к богатым людям. Родители его были средними обывателями, но чисто русского происхождения. Семнадцатилетним юношей пришел учиться в Славяно-Греко-Латинскую академию, где пробыл с 1686 до 1694 года, затем связал свою судьбу с Навигацкой школой, где преподавал математические науки, и был ее руководителем до конца жизни. Это был один из образованнейших русских людей своего времени. Имел обширные познания в математике, русской словесности, знал теорию навигационных наук и владел языками: греческим, латинским, немецким и итальянским.