Другим спорным пунктом плана было участие истребителей в налете. Генда был против того, чтобы отправлять в налет крупные силы истребителей, оголяя авианосцы перед возможным ответным ударом противника. Генда считал, что для успешного осуществления к операции следует прилечь 300 самолетов, базирующихся на шести авианосцах. В то время ВМФ Японии располагал четырьмя авианосцами, еще два авианосца — «Сёкаку» и «Дзуйкаку» — находились на последних стадиях постройки. Это отодвигало начало операции как минимум на лето 1941 года. План предусматривал использовать в нападении самолеты 11 — го воздушного флота, поскольку летчики и техники уже имели богатый опыт их эксплуатации.
В марте 1941 года Ямамото и Генда приступили к новому туру обсуждений плана. Спустя два месяца все детали удалось согласовать. Оставалось решить несколько технических вопросов, к сожалению, решение многих из них оттянули до последней минуты.
Пока шли учения японских авианосцев в заливе Кагосима, разведка на Гавайях следила за маневрами американского флота. 22 марта 1941 года японским резидентам на Гавайях было приказано активизировать деятельность и активнее использовать подкуп для получения информации. Американцы перехватили этот приказ, но со странным упорством проигнорировали его.
10 апреля 1941 года был сформирован 1-й воздушный флот. Одновременно сформировали 1-й дивизион авианосцев, в состав которого вошли «Акаги» и «Kara». Сопровождение авианосцев обеспечивали четыре эсминца. В состав 2-го дивизиона авианосцев вошли «Сорю» и «Хирю» с четырьмя другими эсминцами сопровождения.